Upravni odbor je izvršno tijelo Skupštine Saveza i sastoji se od 9 članova. Članove Upravnog odbora bira Skupština Saveza na prijedlog Predsjednika Saveza, a širi popis kandidata mogu predlagati udruge članice Saveza iz svojih redova. Predsjednik i Podpredsjednik Saveza su ujedno po svom položaju i Predsjednik i Podpredsjednik Upravnog odbora. Pri izboru preostalih 7 članova mora se ispoštovati kriterij da ni jedna udruga članica ne može imati više od 1 člana u Upravnom odboru. Mandat članu Upravnog odbora traje 4 godine koliko i mandat predstavnika u Skupštini s mogućnošću ponovnog izbora. Upravni odbor radi u sjednicama koje saziva i kojima predsjedava Predsjednik Upravnog odbora. Sjednicama Upravnog odbora obvezno prisustvuju Glavni tajnik, Poslovni tajnik i Stručni tajnik koji imaju pravo i obvezu sudjelovati u radu Upravnog odbora, ali bez prava glasovanja. Zadaće i obveze Upravnog odbora detaljno su definirane Statutom Hrvatskog saveza uzgajivača ovaca i koza.
Na skupšini Hrvatskog saveza uzgajivača ovaca i koza održanoj 15.10.2015. u Upravni odbor Saveza izabrani su: